南京市诺如病毒GⅡ.4/Sydney变异株感染疫情的病原学研究

摘要：

目的 对一起南京高校诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确认其病原体,并对其基因进行分型研究.方法 用荧光定量PCR法对采集的50份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,对阳性标本采用诺如病毒的开放读码框架2(ORF2)基因N/S区域(N-terminus/shell region)进行RT-PCR扩增、测序,结合诺如病毒Ⅱ型各基因型参考株序列进行序列比对和进化树分析.结果 荧光定量PCR检测的50份疫情样本中,诺如病毒Ⅱ型核酸阳性12份,其中5份病毒用RT-PCR扩增出条带,其N/S区域序列与2012年全球流行的新型诺如病毒GⅡ.4/Sydney变异株同源性高达97.7％ ～ 98.8％.结论 序列测定结果证实这是南京首次由GⅡ.4/Sydney诺如病毒变异株引起的暴发疫情,在日常监测样中也发现该型病毒散发感染,提示该型病毒将是本市今后防控监测的重点.

关键词：诺如病毒、遗传组、基因型、序列分析

所属期刊栏目：24

分类号：R512.5(传染病)

资助基金：青奥会食品安全保障关键技术应用与示范项目2011-BAK21B00;南京市卫生青年人才培养工程项目QR-X11039

在线出版日期：2015-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3501-3504