惠州市手足口病病原构成及肠道病毒71型VP1基因序列分析
目的 探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据.方法 采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒型别,对EV71型分离株进行VP1片段测序,测序结果利用DNAStar软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega 5.0软件构建系统发生树.结果 通过real time RT-PCR特异性检测发现,EV71、Cox A16和其他肠道病毒的阳性率分别为56.69％ (284/501)、10.38％(52/501)、13.17％ (66/501).测序结果表明12株EV71分离株之间的VP1基因核苷酸同源性为97.9％～99.6％,氨基酸同源性为99.3％ ～ 100％.构建系统发生树表明,12株病毒基因与C基因型代表株与C4基因亚型最为相近,并且可进一步划分为C4a进化枝.说明本研究的12株病毒皆属于EV71病毒C基因型、C4a亚型.结论 EV71和CoxA16是本地区手足口病的主要病原体,因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病.EV71型惠州分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全一致.
手足口病、肠道病毒71型、C4基因亚型、VP1区
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R512.5(传染病)
2014-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
2957-2960,2965
