2012年上海市徐汇区人肠道病毒5′非编码区序列分析

摘要：

目的 通过分析HEV的5′-UTR基因序列,确定上海市徐汇区手足口病(HFMD)病例中HEV的型别.方法 采集2012年HFMD患儿标本,采用Real time-RT-PCR分别检测HEV、EV71和CoxA16核酸,初步鉴定其型别.从中挑选未能分型的HEV毒株扩增其5′-UTR进行核苷酸序列测定,运用DNAStar和MEGAS.2软件进行序列分析.结果 26例标本均为HEV阳性:10例EV71阳性,5例CoxA16阳性,11例其他型HEV阳性.扩增11例未能分型的HEV标本的5 ′-UTR序列,9例测序成功,通过序列比对确定病毒型别:CoxA16 8例,CoxA10 1例.结论 上海市徐汇区HFMD患儿的主要病原是EV71和CoxA16,也存在着其他型别的HEV,如CoxA10,应加强HEV基因亚型的分布及流行特点的监测.

关键词：手足口病、人肠道病毒、5′非编码区

所属期刊栏目：24

分类号：R725.1(儿科学)

在线出版日期：2014-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1756-1759