副溶血性弧菌肠道细菌基因间重复序列基因分型研究

摘要：

目的 检测副溶血性弧菌热稳定溶血素(TDH)基因(tdh),并采用肠道细菌基因间重复序列(Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR,ERIC-PCR)基因分型技术对tdh阳性和阴性菌株进行聚类分析.方法 PCR法扩增79株分离自患者和海产品中的副溶血性弧菌tdh基因.ERIC-PCR分型PCR产物中某一特定大小片段存在标记为1,否则标记为0,形成二进制独特矩阵,定义为一个基因型,用聚类分析软件NTsys 2.10e对所有菌株、tdh阳性组和阴性组进行聚类分析.结果 患者组、海产品组中分离菌株tdh阳性率分别为87.8％ (43/49)和3.3％ (1/30),患者中所分离的副溶血性弧菌tdh阳性率明显高于环境中所分离的(x2=19.11,P＜0.01).79例菌株可获得产物长度160 bp、360 bp、420 bp、500 bp、680 bp、800 bp、950 bp、1 100 bp、1 350 bp、1 550 bp、1 800 bp、2 100 bp和2400 bp共13种大小不同的PCR产物片段,所有菌株根据扩增片段分布可分为17类,有3个明显族.结论 ERIC-PCR聚类分析结果表明,我国分离的副溶血性弧菌具有较高基因多态性,tdh阴性组离散度高于tdh阳性组.

关键词：副溶血性弧菌、聚类分析、肠道细菌基因间重复序列、热稳定溶血素

所属期刊栏目：23

分类号：R378.3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：宁波市农业社会发展项目资助2011C50041

在线出版日期：2014-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：3170-3171,3180