一例重症手足口病死亡患儿柯萨奇病毒B5型VP4区基因特征分析

摘要：

目的:对一例重症手足口病死亡患儿肠道病毒型别进行鉴定,分析VP4区基因特征,了解其变异情况.方法:提取病毒RNA,用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR(RT-nPCR),通过测序和Blast比对确定肠道病毒型别;并对其VP4区进行序列和进化分析.结果:RT-nPCR扩增目的片段测序结果经Blast比对确定为柯萨奇病毒B5型(CoxB5),命名为BJ09-237 (Genbank登录号为JF430480).其VP4区全长207bp,与CoxB5参考序列在VP4区的核苷酸同源性为79%～98%,氨基酸同源性为95%～100%,与广东株HQ005438及俄罗斯株GQ281602在同一进化树分支上.BJ09-237在VP4区无氨基酸的缺失和插入,未发现其所特有的氨基酸置换.结论:该重症手足口病死亡患儿CoxB5的VP4区基因序列未发生明显变异.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒B5型、进化分析

所属期刊栏目：21

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2012-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2377-2378,2381