一起由肠道病毒CoxB4引起的手足口病聚集性疫情的病原学鉴定及其基因型分析

摘要：

目的:对引起一起手足口病聚集性疫情的未分型肠道病毒进行病原学鉴定,并分析其基因型.方法:对采集的标本用Real-time PCR方法检测肠道病毒核酸,并选取其中通用阳性,EV71和CoxA16阴性的标本用自行设计长距离PCR通用引物进行两步法RT一PCR,将得到的PCR产物进行测序,将所得序列在GenBank中进行同源性搜索以确定是何种血清型肠道病毒,同时选取部分标本进行全序列的测定并构建分子系统树,从而确定引起本次手足口肠道病毒为何种基因型.结果:34份标本经Real一time PCR检测,19份标本肠道病毒核酸通用阳性,EV71阴性和COX16阴性,选取其中的10份测定其VP1区序列,经同源性搜索确定为肠道病毒CoxB4,且10标本的序列同源性均在99%以上.全序列测定结果与其他CoxB4进行系统发生分析显示,本次分离到的CoxB4属于第Ⅷ类基因型.结论:引起本次手足口病聚集性病例的病原为肠道病毒CoxB4,第Ⅷ类基因型.

关键词：肠道病毒CoxB4、手足口病、分子分型、血清型、基因型、同源性搜索、分子系统树

所属期刊栏目：21

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2012-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2361-2363