肺炎克雷伯菌新德里金属β-内酰胺酶结构功能分析
目的:描述新出现的肺炎克雷伯菌超级耐药酶-新德里金属β-内酰胺酶(NDM-1)氨基酸序列的结构功能特征,及时提供潜在有用的超抗细菌诊断、预防、抗生素的协同治疗药物研制和分子流行病学信息.方法:采用生物信息频谱分析平台,对NDM-1氨基酸序列进行结构和功能及活性多肽特性的研究,包括ClustalW、MEGA、Modeller和PyMOL等方法.结果:NDM-1的核苷酸和氨基酸序列与亲缘关系较近的意大利维罗纳金属β-内酰胺酶(VIM-1)的相似性分别为44.6%和32.6%,同源性较低.所分析的NDM-1的270个氨基酸区域有共同的信息频谱特征,其主峰特征为F(0.2074,3),显示了NDM-1的共同作用模式.对NDM-1预测的N110D和D199G氨基酸残基变异明显增加了F(0.2074)的特征峰高,可能对抗生素作用的模式有较大正影响;预测的G69D和D192G氨基酸残基变异明显减小了F(0.2074)的特征峰高.可能对抗生素作用的模式有较大负影响.NDM-1的78-104位区域是细菌/抗生素反应活性热点,它的许多残基分布在该酶同源建模3D结构的表面.同源建模显示NDM-1特有的4个氨基酸短肽在该酶3D结构的表面.NDM-1和金属锌离子的结合位点具有金属β-内酰胺酶B1亚型的保守性.结论:这些数据和信息较深层次地显示了新出现的NDM-1酶的结构和功能特点、相关的氨基酸的预测变异和活性多肽的同源建模的3D分布.可为今后预防和处置NDM超抗细菌的感染和流行,扩展鉴别潜在的治疗和诊断的分子靶标,提供分子生物学基础.
多重耐药病原菌、肺炎克雷伯菌、新德里金属β-内酰胺酶、信息频谱分析
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R378.99+6(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
2011-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
543-547
