新型H1N1流感病毒HA基因特性分析

摘要：

目的:了解新甲型H1N1流感病毒HA基因特性.方法:设计3对引物,对9株天津地Ⅸ新甲型H1N1流感病毒阳性的咽拭子标本核酸进行RT-PCR扩增,后对产物测序.将测序结果通过软件进行拼接,得到HA基因全长,分析序列特征并绘制种系发生树.结果:9株新甲型H1N1流感病毒HA基因片段测序成功,经序列拼接后.长度为1778 bp,截取开放读码框内1702 bp核苷酸,绘制了种系发生树.新甲型H1N1流感病毒HA基因与经典的猪流感病毒亲缘关系最近,聚在一个分支上.天津地区新甲型H1N1流感病毒HA蛋白氨基酸与WHO推荐的疫苗株A/California/07/2009(H1N1)及中国的代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)相比,同源性很高,为98.8%-99.6%.氨基酸序列与WHO推荐的疫苗株A/California/07/2009(H1N1)相比,有4个位点发生变异,与中国的代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)相比,有3个位点不同.结论:新甲型H1N1流感病毒HA基因源于经典猪流感病毒,目前的新甲型H1N1流感病毒的HA蛋白变异还很小,但应密切关注该病毒的变异情况.

关键词：新甲型H1N1流感病毒、HA基因种系发生

所属期刊栏目：20

分类号：R373.1+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：天津市科技支撑计划重大项目;天津市疾病预防控制中心科技基金

在线出版日期：2011-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3121-3124