甲型流感病毒A/Lishui/01/2009(H1N1)株HA基因序列分析

摘要：

目的:测定流感病毒HA基因序列,从分子水平分析丽水市输入性甲型H1N1流感病毒株HA基因特点.方法:Real-time PCR检测甲型HlNl流感病毒核酸,RT-PCR测定HA基因核苷酸序列.结果:测序获得位于流感病毒HA基因436 bp～1701 bp位置、长度为1266 bp的核苷酸片段.多序列比对显示A/Lishui/01/2009(H1N1)株与北美人感染猪流感A/California/04/2009(H1N1)株序列的相似性最高(nt/aa,99.8/99.3%);与其他甲型H1N1流感病毒株序列相似性均比较高(nt/aa,99.4～99.9%/99.1～99.8%),与季节性甲H1型流感代表株A/Brisbane/59/2007(H1N1)序列相似性最低(nt/aa,76.4/80.0%).种系分析显示A/Lishui/01/2009(H1N1)株与其他甲型H1N1流感病毒,北美猪流感病毒均位于同一进化分支,亲缘关系最近,与季节性甲H1流感代表株A/Brisbane/59/2007(H1N1)进化关系最远.结论:丽水输入性流感病毒A/Lishui/01/2009(H1N1)株属于甲型H1N1流感病毒,与北美猪流感病毒同源并隶属于传统猪流感病毒.

关键词：流感病毒、血凝素、序列分析

所属期刊栏目：20

分类号：R373.1+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2011-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1289-1291