使用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌

摘要：

目的:测试应用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌的适用性.方法:用16S rDNA基因的扩增引物,对从腹泻者、水产品和环境中分离获得的副溶血性弧菌(n=39)及临床分离的15种(n=181)常见菌的基因组DNA进行聚合酶链反应,产物经琼脂糖凝胶电泳纯化后直接测序.序列通过blastn,在GenBank中比对,确定细菌属种并与表型法结果进行比较.结果:220株菌(220/220)扩增出870 bp的目的片段,平均测序长度752 bp.36/39株副溶血性弧菌鉴定结果与生化培养法相符,3株菌株分别鉴定为科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii),表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)和Oceanobacillus profundus.181株其它临床分离菌无误判为副溶血性弧菌,其中123株与生化培养法结果一致,58株有差异.结论:本文报告的16S rDNA基因序列分析可用于准确鉴定副溶血性弧菌,并可与15种临床常见分离菌区分.

关键词：16S rDNA分析、副溶血性弧菌、临床菌株

所属期刊栏目：19

分类号：R378.3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：上海市科委技术标准专项;上海申康医院发展中心病原体检测技术平台资助项目

在线出版日期：2010-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2034-2036,2094