云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因进化特征分析

摘要：

目的:认识2003年～2008年期间云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因的进化特征.方法:2003年～2008年期间在云南边境采集境外禽类样品380份,经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析.结果:多重RT-PCR检出18份阳性样品,阳性率4.74%;14份代表性病毒样品HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于93.1%～99.3%、90.5%～99.1%;HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;系统发育分析表明阳性样品可划分为5个不同进化分枝(1、2.4、2.3.2、2.3.4、7).结论:2003年～2008年期间云南边境境外H5N1亚型病毒问具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株已成为当地流行的优势毒株.

关键词：禽流感病毒、H5N1亚型、血凝素、进化特征、进化分枝

所属期刊栏目：19

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：全军科技攻关项目08G034;云南省科技攻关项目2006NG-24;云南省后备人才基金2005PY01-12

在线出版日期：2010-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1216-1218,1247