肠道病毒71型浙江毒株全基因组核苷酸序列测定分析
目的:了解肠道病毒71型在浙江的流行和变异情况以及目前中国流行株的遗传学背景.方法:RT-PCR反应测定EV71型浙江病毒株(Zhejiang08)全基因组核苷酸序列,并进行序列的同源性比较和种系发生分析.结果:Zhe-jiang08株病毒全基因组核苷酸序列长度为7406 bp,与中国大陆安徽阜阳毒株17.08/1和17.08/3整个基因组核苷酸同源性为98.2%和98.3%,氨基酸同源性均为99.4%;与广东深圳毒株SHZH98和SHZH03基因组核苷酸同源性为90.9%和94.2%,氨基酸同源性为98.8%和98.5%;与EV71国际标准株MS/7423/87和BrCr基因组核苷酸同源性仅为81.7%和79.7%,氨基酸同源性为95.7%和96.1%.对外壳蛋白VP1编码区进行种系发生分析显示中国大陆分离的5株EV71病毒与中国台湾4株病毒进化关系较近,与国际标准株以及东南亚毒株进化关系较远,其中浙江与安徽毒株进化关系最近.结论:EV71型病毒Zhejiang08株全基因组的组成和结构符合肠道病毒特征,与其它EV71型病毒具有相同的基因组结构,Zhejiang08株与中国大陆阜阳和深圳毒株亲缘关系最近,与台湾流行株亲缘关系较近,而与新加坡、马来西亚流行株的差别较为明显,与国际标准株则有较大的差异;Zhejiang08株与安徽阜阳毒株具有共同的进化途径,推断Zhe-jiang08株与阜阳毒株可能共同来源于近年来在广东深圳地区流行的EV71病毒株甚至有可能来源于EV71病毒1998年在台湾大规模流行时的毒株.
肠道病毒、EV71、全基因组、序列分析
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R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
2010-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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