湖南省2004年流感病毒优势流行毒株甲3亚型基因特性分析

摘要：

目的:了解2004年湖南省流感病毒优势流行毒株甲3亚型的基因特性变异特征.方法:取病原学监测中分离到的13株甲3亚型流感病毒毒株,经鉴定后用鸡胚传代,收获尿囊液提取病毒RNA,进行逆转录-聚合酶链反应(RTPCR),扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序;测序结果使用Flu Sequence DatasetExplorer工具进行比较,通过与NCBI数据库中2000～2005年中国的流感病毒H3N2株同源比对后,绘制种系发生树.结果:所测13株甲3(H3N2)亚型毒株的HA1区的320个氨基酸,与甲3亚型国际疫苗株A/Wuhan/359/1995相比,抗原决定簇E区、A区、D区、B区及受体结合位点(RBS)后壁和左壁均有多个位点发生氨基酸替换.与2002年流行的A/Fujian/411/2002甲3亚型代表株相比,抗原决定簇及受体结合位点亦有单个或多个位点氨基酸发生了替换.种系发生树显示,13株甲3亚型人流感病毒中有9株同源性较大,独立形成一簇,与A/Fujian/52/2004较为接近.另外1株与我省2002年分离的毒株最为接近.最后3株则整合进2003～2004年其他省分离到的毒株所形成的簇中.结论:湖南省2004年流感优势流行毒株甲3亚型流感病毒的HA1基因特性发生了变异,可能是导致其流行的主要原因.在HA1基因进化上,时间比地理分布起着更重要的作用.

关键词：流感病毒、HA1基因、氨基酸序列、种系发生树

所属期刊栏目：16

分类号：R373.1+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2006-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：164-166