COL1A1在胃癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 利用生物信息学手段探讨胃癌中的差异表达基因及其临床意义.方法 收集四个GEO胃癌数据集及TCGA胃癌数据集.分析各数据集中癌周组织和癌组织间存在显著表达差异的基因.对整合后的差异表达基因进行GO基因富集分析及KEGG信号通路富集分析.同时对差异表达基因编码的蛋白质进行蛋白互作网络分析.最后利用TCGA数据集分析了COL1A1基因的表达水平及其与患者TNM分期和生存的关系.结果 整合四个GEO数据集的结果发现在癌周组织和癌组织间存在105个具有显著表达差异的基因,其中34个基因上调,71个基因下调.其中COL1A1可能参与细胞外基质的调控,处于蛋白互作网络的核心地位.在四个GEO数据集和TCGA数据集中COL1A1均在胃癌组织中存在高表达.COL1A1在较晚TNM分期的患者组织中存在高表达,COL1A1表达较高的患者预后较差.结论 COL1A1可能作为胃癌的诊断指标、治疗靶点或者预后评估标志物.

关键词：胃癌、细胞外基质、COL1A1、GEO数据库、TCGA数据库、生存率、预后

所属期刊栏目：10

分类号：R361(病理学)

在线出版日期：2019-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：104-108