10.3760/cma.j.issn.1671-0274.2012.03.027
长链非编码RNA调节细胞周期素D1表达对结直肠癌细胞辐射敏感性的影响
目的 筛选影响结直肠癌细胞辐射敏感性的长链非编码RNA(lncRNA)并探讨其作用机制.方法 选取RKO和Lovo结直肠癌细胞株梯度照光后行克隆形成实验,应用单击多靶数学模型计算存活分数SF2值并绘制剂量存活曲线;高通量lncRNA/mRNA芯片筛选在RKO与Lovo、以及2Gy照光前后RKO细胞中表达差异2倍以上的lncRNA基因和蛋白编码基因;采用Gene Ontology联合Pathway综合分析阳性表达基因主要作用通路;实时PCR进一步检测验证RKO细胞株照光前后P53、P21、细胞周期素(cyclin)D1表达变化.结果 克隆形成实验显示,Lovo细胞株SF2=0.47,RKO细胞株SF2=0.53,Lovo辐射敏感性显著高于RKO(P<0.05).高通量lncRNA/mRNA芯片筛选得到阳性表达长链非编码RNA基因268条,蛋白编码基因270条;Gene Ontology联合Pathway综合分析显示:细胞周期相关基因所占比重最大(38.6%),并有多条lncRNA表达水平与cyclin D1编码基因CCND1组间表达差异显著相关.RKO与Lovo两株细胞P53和P21相对表达量的差异均无统计学意义(P>0.05),RKO细胞cyclin D1相对表达量明显高于Lovo细胞(P<0.05);RKO细胞株经2Gy剂量照射前后,P53和P21相对表达量的差异无统计学意义(P>0.05),而cyclin D1表达明显下调(P<0.05).结论 lncRNA可能通过形成转录复合物与CCND1基因结合,调节cyclin D1蛋白表达进而影响结直肠癌细胞辐射敏感性;且lncRNA对cyclin D1表达的调节不依赖于P53-P21-cyclin D1通路.
结直肠肿瘤、长链非编码RNA、细胞周期素D1、辐射敏感性、高通量芯片
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R574(消化系及腹部疾病)
国家自然科学基金30973460
2012-07-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
288-291