四川省甘孜州藏猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查

摘要：

为了解甘孜州藏猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,分析其相似性和遗传进化关系.本试验用反转录套式聚合酶链反应(RT-nPCR)方法对采集于2018-2019年甘孜藏族自治州藏猪主要养殖区域4个县10个藏猪养殖场的229份藏猪粪便样本进行核酸检测,并对全部阳性样本进行ORF2基因部分片段扩增测序,遗传进化分析.结果显示:猪粪便HEV核酸阳性率为 16.59％(38/229,95％CI=12.00％～22.10％),猪场 HEV 阳性率为70％(7/10,95％CI=34.8％～93.3％);38个ORF2基因片段彼此之间核苷酸序列相似性为76.1％～100.0％,推导的氨基酸序列相似性为79.6％～100.0％,系统进化树分析显示所有阳性毒株均为基因4型,且与人源HEV毒株亲缘关系近.结果表明甘孜州藏猪中存在一定程度的HEV感染,与人源HEV毒株遗传关系近,相关部门采取防控措施以降低HEV感染的公共卫生风险.

关键词：甘孜州、藏猪、戊型肝炎病毒、遗传进化分析

所属期刊栏目：58

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：四川省甘孜州应用基础研究;国家自然科学基金

在线出版日期：2022-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：6-11