华东地区猪A群轮状病毒的VP7和VP4基因序列分析

摘要：

为了掌握华东地区猪轮状病毒(PRV)的流行情况,通过对华东地区猪轮状病毒流行病学的调查,分析临床猪轮状病毒对应的2个抗原序列VP7和VP4的基因型,进而丰富VP7和VP4基因库.采集2017-2018年华东地区包括江苏、浙江、上海、山东、安徽等省(市),部分猪场猪的粪便拭子共201份,PCR检测PRV阳性52份,阳性率25.9％.选择5个阳性样本进行VP7和VP4基因全长扩增并克隆测序,应用DNASTAR、MEGA5等生物学软件对其进行比对分析.结果 显示:5个VP7核苷酸序列全长均为1062 bp,5个VP4序列全长均为2362 bp.VP7与2008年分离的G9型代表毒株NMTL的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为93.2％～95.2％和97.2％ ～97.5％.VP4与OSU毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为98.5％～98.7％和99.3％ ～99.4％.表明这5株猪轮状病毒的基因型鉴定为G9P7.与参考毒株相比,VF7氨基酸第100、122、180、309位有突变,但无插入和缺失现象,VP4氨基酸在第30、137、686、774位有突变,但无插入和缺失.

关键词：华东地区、VP7、VP4、序列分析、猪A群轮状病毒、抗原表位

所属期刊栏目：55

分类号：S852.65+1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金

在线出版日期：2020-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：3-7,12