猪圆环病毒2型吉林分离株的全基因组序列分析

摘要：

采用PCR扩增l株吉林新分离的PCV2-2017全基因组序列,经过测序拼接后进行了序列分析.毒株PCV2-2017基因全长1 767 bp,在GenBank上进行同源性比对,同源性在96％ ～ 99％之间;与法国株AF055394同源性可达99％,与美国株AF055391、四川株HM102350同源性最低,为96％.PCV2中ORF1编码Rep蛋白,核苷酸和氨基酸同源性达到99％,ORF1突变很小,相对保守;ORF2基因全长为702 bp,编码Cap蛋白,氨基酸同源性达94％ ～ 99％,核苷酸同源性与美国株比对,可达96％,与法国株和国内部分毒株同源性达99％,是变异主要发生部位,共有12处点突变;ORF3编码蛋白,核苷酸同源性高达100％,说明变异不大.基因的遗传进化分析表明,PCV2-2017吉林新分离株全基因组与法国株AF055394亲缘关系最近,同属于PCV-2b亚型;与AY322001、AB426905和国内GU370064、AY691169、AY969004、DQ180393毒株亲缘关系较远.

关键词：猪圆环病毒2型、全基因组序列、序列分析

所属期刊栏目：54

分类号：S852.659(动物医学（兽医学）)

资助基金：吉林省科技发展计划项目20162005;吉林农业科技学院博士启动基金项目吉农院合字[2014]第412号

在线出版日期：2019-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：7-9