临床手足口病肠道病毒71型VP1基因分析

摘要：

目的 对临床手足口病(HFMD)的病原体肠道病毒71型(EV71)分离株VP1基因测序分析,从分子水平探究HFMD的分子遗传进化变迁情况.方法 收集2015年1月至2016年12月期间在延安医院临床就诊疑似HFMD患者590例,采集粪便标本,用实时荧光PCR法进行EV71病毒核酸检测,对EV71检测阳性粪便样本进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增VP1目的基因,扩增阳性产物进行测序和序列比对,分析同源性并确定其所属基因亚型,并构建种系遗传进化发育树.结果 共检出EV71型50例,检出率为8.47％(50/590例),2015年检出28例,2016年检出22例.50例中≤5岁35例,5-18岁13例,≥18岁2例;男性占64.00％(32/50例),女性36.00％(18/50例),女性患者中包括2例成人HFMD患者.检出的50株EV71毒株均为EV71 C4亚型.检出的EV71毒株与国内北京和安徽以及马来西亚地区的毒株遗传距离为0.026,与浙江、广东地区毒株的遗传距离为1.52,与澳大利亚地区毒株的遗传距离为2.11.结论 亲缘关系进化树显示,EV71毒株2年间未发生大的基因遗传变异.EV71毒株与北京、安徽以及马来西亚EV71流行毒株遗传距离较近,与浙江、广东等地的EV71流行毒株遗传距离较远,与澳大利亚分离的EV71毒株遗传距离最远.

关键词：手足口病、肠道病毒71型、VP1基因、DNA测序、系统发育树

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分类号：R725.1(儿科学)

资助基金：云南省应用基础研究项目2014FB080;云南省应用基础研究-昆医联合专项2014FZ004

在线出版日期：2018-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：811-814