基因芯片技术在乙肝病毒基因型及YMDD变异检测中的应用

摘要：

目的 评价基因芯片技术在HBV基因型及HBVP基因YMDD变异检测中的应用价值,并对不同基因型病例的临床情况进行分析.方法 抽提HBV DNA,用PCR方法扩增S基因及P基因部分区域,扩增产物与基因芯片上的寡核苷酸探针进行杂交,杂交结果通过芯片影像读取仪扫描到计算机上,经软件分析可得到HBV基因型、HBVYMDD野生型及YVDD、YIDD变异型结果;部分标本通过HBV preS/S基因序列测序证实.结果 38份高病毒滴度标本(HBV DNA定量＞1.0×105拷贝/毫升)中22例为B基因型(58%),16例为C基因型(42%);32例为HBV YMDD野生型,2例为YVDD变异型、4例为YIDD变异型.临床情况方面,无症状携带者中有2例为基因型B、3例为基因型C,慢乙肝患者中有16例为基因型B、12例为基因型C,肝硬化患者中有4例为基因型B、1例为基因型C;B型和C型患者e抗原阳性率分别为54.5%(12/22)和87.5%(14/16).10份HBVDNA定量＜1.0×105拷贝/毫升的标本不能检测出HBV基因型及YMDD变异情况.11例阳性标本的基因测序结果与基因芯片检测结果一致.结论 (1)基因芯片检测HBV基因型及HBV P基因区YMDD变异准确性高、特异性好,同时每次实验得到的信息量多,适合于临床开展应用,但需提高灵敏度;(2)C基因型乙肝患者HBV e抗原阳性率高于B型患者.

关键词：肝炎病毒、乙型、基因芯片、基因型、YMDD变异

所属期刊栏目：11

分类号：R4(临床医学)

资助基金：广州市卫生局重点课题2004Z008

在线出版日期：2007-04-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：207-212