儿童Ph+及Ph-like急性T淋巴细胞白血病二代测序分析

摘要：

目的:利用生物信息学方法筛选费城染色体阳性/费城染色体样急性T淋巴细胞白血病(Ph+/Ph-like T-ALL)核心基因,并分析其核心子网络,探讨Ph+/Ph-like T-ALL发生发展过程中的调控机制并寻找可能用于临床诊疗的分子靶点.方法:收集重庆医科大学附属儿童医院Ph+/Ph-like T-ALL患儿WES/RNA-seq检查结果,同时从GEO数据库中下载符合要求的基因数据,运用GRO2R在线差异表达基因筛选程序筛选差异性表达基因,并对差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG通路分析,同时使用STRING数据库,利用Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,筛选出hub gene及核心子网络.结果:Ph+/Ph-like T-ALL共找出84个差异表达基因,Ph+ALL共找出249个差异表达基因,T-ALL共找出175个差异表达基因.综合GO功能富集、KEGG通路富集分析及蛋白相互作用网络结果,筛选出RPA1、POLD1、POLE、SOCS1为hub gene.DNA损伤修复及JAK/STAT信号转导通路为筛选到的主要功能子网络.结论:Ph+/Ph-like T-ALL患儿体内存在明显的DNA损伤修复通路异常,RPA1、POLD1、POLE可能是Ph+/Ph-like T-ALL发生、发展的重要相关生物标志,这可以为进一步研究提供依据.

关键词：费城染色体;费城染色体样急性T淋巴细胞白血病;二代测序;基因富集分析

所属期刊栏目：29

分类号：R733.71(肿瘤学)

在线出版日期：2021-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1101-1108