单独骨髓复发儿童急性B淋巴细胞白血病的生物信息学分析及验证

摘要：

目的:分析影响儿童急性B淋巴细胞白血病单独骨髓复发患儿预后的枢纽基因.方法:从TCGA数据库下载符合要求的高通量RNA测序数据,运用R语言DESeq2程序包筛选出差异表达基因,并对这些基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,同时使用STRING数据库数据和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,筛选枢纽基因和高度蛋白互作子网络并分别进行功能富集和通路富集分析,用JASPAR数据库筛选枢纽基因启动子上游转录因子,结合TCGA数据库附带的临床信息对枢纽基因进行生存分析,进而采集临床患者的骨髓样本和病历资料,通过临床样本验证枢纽基因分析结果.结果:共筛选出847个差异表达基因,其中上调的差异表达基因813个,下调的差异表达基因34个,筛选出枢纽基因11个.RPS5、RPS15、RPL23、RPL35、RPS8、RPS27A、RPS3、RPL9、RPS21、RPS7、RPL38对患儿生存有明显影响,且ZNF460可能参与它们的调控,其中RPS3、RPS15、RPS8、RPS27A、RPS21的高表达在复发患者的临床样本得到了验证.结论:RPS3、RPS15、RPS8、RPS27A、RPS21有望作为提示单独骨髓复发这一恶性事件的生物标志物,且可能被ZNF460调控.

关键词：生物信息学;急性淋巴细胞白血病;骨髓复发;儿童

所属期刊栏目：29

分类号：R733.71(肿瘤学)

在线出版日期：2021-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1039-1049