HLA-B新等位基因B*3936的确认和测序分析

摘要：

本研究确认HLA新等位基因HLA-B*3936并分析其序列.先证者为脐血造血干细胞捐献者,样本DNA抽提采用PEL-FREEZ抽提试剂盒,利用单链特异性引物PCR方法扩增先证者HLA-B基因的第2-4外显子,对PCR产物直接进行第2、3、4外显予双向测序分析.结果显示:先证者样本中存在2个HLA-B等位基因,其中1个等位基因为HLA-B*4002,另1个经Blast验证确定为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ242650,DQ242651,DQ242652).与最接近的B*3901等位基因比较,新的等位基因在第3外显子上有4个核苷酸的差异,其中第527位T→A、第538位C→T、第539位T→G、第544位A→G,这引起氨基酸第152位缬氨酸(Val)→谷氨酸(Glu)、第156位异亮氨酸(Ⅱe)→色氨酸(Trp)、第158位苏氨酸(Thr)→丙氨酸(Ala).实验结果提示该等位基因为新的HLA-B等位基因,已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*3936.

关键词：HLA-B等位基因、HLA-B*3936、测序分析

所属期刊栏目：15

分类号：R457.11;R457.1(治疗学)

资助基金：浙江省医药卫生科研项目2003Z003

在线出版日期：2008-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1281-1283