巯嘌呤甲基转移酶基因多态性分析方法探讨

摘要：

建立以PCR为基础的位点特异性PCR、限制性内切酶消化、变性高效液相色谱分析和SNaPshot定点的序列分析等方法,并结合DNA直接测序检测巯嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因的5个单核苷酸多态性(SNP)位点的多态性频率.在实验过程中还探讨基因多态性检测的方法学,比较几种方法的可信度、可行性及其优劣.研究结果显示,限制性内切酶消化法能准确地检测TPMT基因外显子区的SNP,变性高效液相色谱分析技术能快速筛选出TPMT第5和第10外显子区的SNP,但不能检测出第7外显子的SNP;位点特异性PCR不能检测出TPMT基因外显子区的SNP, SNaPshot定点的序列分析检测TPMT基因外显子和启动子区的SNP准确率高.通过比较几种SNP检测方法后获得的结论是,TPMT基因SNP位点的检测应根据标本量和实验条件首选限制性酶切消化法、DNA测序或SNaPshot定点序列分析,有时一种技术不能完全满足检测的需要,必须几种方法的相互补充.

关键词：巯嘌呤甲基转移酶、巯嘌呤甲基转移酶基因、单核苷酸多态性、基因多态性

所属期刊栏目：11

分类号：Q7;Q33

在线出版日期：2003-11-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：458-463