10.16303/j.cnki.1005-4545.2022.10.02
2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析
为分析2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的分子遗传变异情况,本研究利用RT-PCR方法从18个猪场PEDV感染仔猪组织中扩增S1基因部分片段、ORF3基因和N基因,进行核苷酸序列测定,并将PEDV流行株S1基因部分序列、ORF3基因和N基因推导氨基酸序列与参考毒株进行进化树构建与遗传变异分析.测序结果表明,18个猪场存在5株PEDV流行毒株.S1基因部分片段与N基因推导氨基酸进化树与相似性结果表明,5株PEDV流行株与已发表的2010年以后流行株组成G2群,与CV777株为代表的G1群毒株相似性分别为93.0%~96.7%和95.0%~96.8%.ORF3基因推导氨基酸进化树与相似性结果表明,5株PEDV流行株同其他非基因缺失毒株组成G2群,并分别属于G2a(HNXC和HNHC株)和G2c亚群(HNHB、HN-NY和HNZY株),与缺失毒株组成G1群毒株的相似性为88.0%~92.4%,与CV777毒株所在G2b亚群毒株相似性分别为94.7%~96.4%和94.7%~96.9%.氨基酸遗传变异分析结果表明,与经典毒株CV777相比较,5株PEDV流行株的S1部分氨基酸、ORF3氨基酸和N氨基酸分别存在10,5,10个位置发生相同氨基酸置换,以及分别有16,10,14个位置氨基酸不同程度的突变,此外,5株PEDV流行株ORF3氨基酸不存在缺失,具有PEDV强毒株的分子遗传特征.综上所述,豫南地区PEDV流行具有PEDV变异毒株及强毒株的分子遗传特征,可为该地区PED的防控提供理论指导.
猪流行性腹泻病毒、S基因、ORF3基因、N基因、遗传变异分析
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S852.65(动物医学(兽医学))
河南省科技攻关基金资助项目212102110364
2023-01-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
1934-1941