2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析

摘要：

为分析2018-2020年豫南地区猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的分子遗传变异情况,本研究利用RT-PCR方法从18个猪场PEDV感染仔猪组织中扩增S1基因部分片段、ORF3基因和N基因,进行核苷酸序列测定,并将PEDV流行株S1基因部分序列、ORF3基因和N基因推导氨基酸序列与参考毒株进行进化树构建与遗传变异分析.测序结果表明,18个猪场存在5株PEDV流行毒株.S1基因部分片段与N基因推导氨基酸进化树与相似性结果表明,5株PEDV流行株与已发表的2010年以后流行株组成G2群,与CV777株为代表的G1群毒株相似性分别为93.0％～96.7％和95.0％～96.8％.ORF3基因推导氨基酸进化树与相似性结果表明,5株PEDV流行株同其他非基因缺失毒株组成G2群,并分别属于G2a(HNXC和HNHC株)和G2c亚群(HNHB、HN-NY和HNZY株),与缺失毒株组成G1群毒株的相似性为88.0％～92.4％,与CV777毒株所在G2b亚群毒株相似性分别为94.7％～96.4％和94.7％～96.9％.氨基酸遗传变异分析结果表明,与经典毒株CV777相比较,5株PEDV流行株的S1部分氨基酸、ORF3氨基酸和N氨基酸分别存在10,5,10个位置发生相同氨基酸置换,以及分别有16,10,14个位置氨基酸不同程度的突变,此外,5株PEDV流行株ORF3氨基酸不存在缺失,具有PEDV强毒株的分子遗传特征.综上所述,豫南地区PEDV流行具有PEDV变异毒株及强毒株的分子遗传特征,可为该地区PED的防控提供理论指导.

关键词：猪流行性腹泻病毒、S基因、ORF3基因、N基因、遗传变异分析

所属期刊栏目：42

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：河南省科技攻关基金资助项目212102110364

在线出版日期：2023-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1934-1941