1株鸭源H1亚型禽流感病毒的分离鉴定与全基因遗传进化分析

摘要：

对2018年分离自江苏地区某活禽市场家鸭体内的1株H1亚型禽流感病毒进行了全基因组序列测定和遗传进化分析.BLAST检索结果显示,该分离株的HA、NA基因分别与A/pintail/Taiwan/WB2478/2017(H1 N3)和A/chicken/Yuhuan/YH14/2016 (H1N2)具有最高的核苷酸一致性,表明其为H1N2亚型,命名为A/duck/Huaian/0151/2018(H1N2).进一步结合各基因的系统发生分析,发现该0151株的6个内部基因均与水禽群中的多种亚型低致病性禽流感病毒亲缘关系密切,其中PB2和NS基因分别与国内2013年的鸭源H7N3和H7N7病毒高度同源.关键氨基酸位点分析显示,该病毒HA蛋白裂解位点处的基序为具有低致病性特征的PSIQSR↓ GLF,受体结合位点226Q与228G提示其亲嗜禽类受体;NA蛋白未出现可能导致病毒在陆禽中适应性增强的茎部氨基酸缺失;PB2蛋白也未发生E627K、D701N等与对小鼠毒力增强有关的突变.综上所述,0151分离株基因组来源复杂,可能由不同亚型低致病性禽流感病毒发生重组而形成,但尚未出现利于其宿主范围扩大的重要分子标记.该研究结果将为H1亚型禽流感病毒的流行病学监测提供参考.

关键词：禽流感病毒;H1N2;基因组;遗传进化;H7亚型

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分类号：R373.13;S852.65(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：江苏省博士后基金资助项目;江苏高校优势学科建设工程资助项目;江苏高校青蓝工程资助项目;扬州大学高端人才支持计划基金资助项目;扬州大学大学生科技创新基金资助项目

在线出版日期：2022-01-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2325-2332