不同纤维源日粮下东北梅花鹿瘤胃微生物功能基因的宏基因组分析

摘要：

为了研究不同粗纤维源日粮对梅花鹿瘤胃微生物区系的影响,选择10头健康公鹿分成JG、ZS 2组,每组5头,分别以玉米秸叶和柞树叶作为粗纤维源,试验时期为2个月,提取梅花鹿瘤胃液中微生物总基因,构建文库并测序及基因功能注释分析.结果 表明:JG和ZS 2组样本的总碱基数量和总序列数量分别为11150909160和12540742633、75018396和84518090.在JG和ZS 2组样品中约1/2以上的纤维素糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)来自于瘤胃球菌属(Ruminococcus)(JG和ZS 2组样品分别为52.79％和51.07％)和纤维杆菌属(Fibrobacter)(JG和ZS 2组样品分别为14.22％和15.49％).而很大一部分半纤维素酶由Ruminococcus(分别为39.20和37.55％)、普雷沃菌属(Prevotella)(分别为22.68％和20.66％)、Fibrobacter(8.86％,9.48％)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium)(2.27％,1.94％)分泌.此外,共有24个GHs家族参与植物细胞壁多糖的降解,其中GH5、GH9、GH45和GH48为降解纤维素的优势酶类,GH8、GH10、GH11、GH26、GH28、GH51、GH53、GH78对于半纤维素降解起重要作用,而对于寡糖降解起主要作用的有GH1、GH2、GH3、GH43和GH94.结论:当饲喂粗纤维较多玉米叶时,以降解纤维素为主的纤维降解酶的比例升高,而寡糖降解酶在瘤胃中的比例降低;当饲喂含丰富可发酵碳水化合物的柞树叶时,结果相反.

关键词：东北梅花鹿、瘤胃微生物、玉米秸叶、柞树叶、功能基因

所属期刊栏目：40

分类号：S852(动物医学（兽医学）)

资助基金：吉林省科技厅项目资助[2014]-JC-0101026

在线出版日期：2020-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1391-1396