河北省PEDV流行毒株的分离鉴定及遗传演化分析

摘要：

为掌握河北省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和变异情况,2017-2018年本研究在河北地区(秦皇岛、唐山、承德、张家口、廊坊、保定和石家庄)共收集278份疑似猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)病死猪临床样品,采用RT-PCR技术进行PEDV筛查,共检测到53份阳性病料,阳性率为19.1％.通过Vero细胞传代培养,成功分离到1株PEDV毒株,将其命名为CH-HB1-2018,对其进行全基因组测序,结合GenBank中公布的PEDV毒株序列对其进行全基因序列同源性比对及系统进化树分析,结果显示所分离毒株与CV777,CH-S,SM98等早期经典毒株的核苷酸同源性在96.6％～97.6％之间,与2010年后分离的变异毒株JS-HZ2012,LC,JSX2014等的核苷酸同源性在98.9％～99.1％之间,进化树分析结果表明所分离毒株为变异毒株,与JS-HZ2012,JSX2014等变异毒株属于同一进化分支,与同源性分析结果一致.本研究为河北省PEDV的流行情况研究提供了理论依据.

关键词：猪流行性腹泻、流行病学、遗传变异

所属期刊栏目：40

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：河北省现代农业产业技术体系生猪疫病控制创新团队岗位项目;河北省高等学校科学技术研究项目青年基金;秦皇岛市科技计划项目

在线出版日期：2020-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1265-1271