猪德尔塔冠状病毒变异株CHN-GX01-2018株全基因序列分析

摘要：

为了解广西PDCoV流行毒株在猪群中的感染和流行特点,用设计的25对特异性引物从腹泻样本中检测获得1株PDCoV全基因组序列.结果 显示,CHN-GX01-2018株基因组全长25 406 bp,与美国毒株比较存在3处基因缺失,分别位于ORF1a/1b第400～403aa、第756～759aa位置及S基因存在1个氨基酸的缺失.全基因组与S基因遗传进化分析结果显示,CHN-GX01-2018与代表株CHN-AH-2004(安徽株)同源性为97.4％.然而,同源性分析显示中国PDCoV株也存在不同的进化分支,表明PDCoV在中国猪群中不断进化.

关键词：猪德尔塔冠状病毒、全基因组序列、遗传变异

所属期刊栏目：40

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划资助项目;温州市基础性科研项目;广西科技重大专项;广西水产畜牧科技项目

在线出版日期：2020-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：483-490