单多羔湖羊下丘脑转录组比较分析

摘要：

通过对湖羊下丘脑组织进行转录组分析,旨在挖掘影响多羔性状的关键功能基因.分别选取三羔组湖羊(n=3)和单羔组湖羊(n=3),利用转录组测序(RNA-Seq)技术对下丘脑cDNA文库进行测序和生物信息学分析,然后采用实时定量PCR验证差异基因在下丘脑组织中的表达情况.通过比较分析转录组数据,共筛选出56个差异基因,其中三羔组中有24个基因上调,32个基因下调.GO分类注释显示,差异基因与器官发育、信号传导、转录调控等生物学过程存在密切关联,同时与DNA结合、蛋白结合、ATP结合等分子事件表现活跃.KEGG通路分析显示,神经信号传递通路、γ-氨基丁酸信号通路可能在湖羊下丘脑调控排卵及卵泡发育方面发挥着重要的调控作用.随机选择5个差异表达的基因进行q-PCR验证,定量结果与测序结果一致.本研究结果为进一步阐述湖羊下丘脑的基本分子机理奠定基础,同时也为全面理解湖羊多羔特性提供新的思路.

关键词：湖羊、下丘脑、转录组测序、实时定量PCR

所属期刊栏目：38

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：江苏省重点研发计划资助项目BE2015362;科技部科技支撑计划子任务资助项目2015BAD03B05-06

在线出版日期：2019-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2352-2359