羊毛尾线虫凉山州分离株的线粒体cox1和Cyt b基因的序列测定及种系发育分析

摘要：

应用PCR技术对分离自四川省凉山州12个山羊源羊毛尾线虫分离株的线粒体cox1基因部分序列(pcox1)和Cyt b基因部分序列(pCyt b)进行扩增和分析.结果显示,所获得的羊毛尾线虫pcox1和pCyt b序列长度分别为843 bp和909 bp,种内变异分别为0.0％～0.5％(7个变异位点)和0.0％～0.1％(1个变异位点),分别检测到7个单倍型和2个单倍型,平均单倍型多样性分别为0.773和0.409,核苷酸多样性分别为0.001 74和0.000 45.构建的种系发育树均显示,12个山羊源羊毛尾线虫凉山州分离株聚在同一小分支,能与其他毛尾线虫相鉴别;不同宿主来源的羊毛尾线虫中国株均聚在同一分支,而羊毛尾线虫西班牙株单独聚为一支,推测不同地方羊毛尾线虫分离株可能存在隐藏种或不同的基因型.结果表明,羊毛尾线虫cox1和Cytb基因序列种内变异小,种间差异较大,故可作为分子标记用于羊毛尾线虫的种间鉴定;羊毛尾线虫凉山州分离株存在一定的遗传变异和遗传多样性,且cox1基因的多样性水平高于Cyt b基因.本研究结果为羊毛尾线虫的分子分类、群体遗传结构和分子流行病学调查等的进一步研究奠定基础.

关键词：羊毛尾线虫、cox1基因、Cyt b基因、种系发育、遗传多样性

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分类号：S852.731(动物医学（兽医学）)

资助基金：四川省教育厅重点资助项目16ZA0267;攀西动物疫病检测与防控四川省高校重点实验室基本科研业务费资助项目;四川地方特色山羊工程中心四川省高校重点实验室基本科研业务费资助项目

在线出版日期：2019-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2327-2333