山羊化脓隐秘杆菌分离鉴定及其神经氨酸酶遗传进化分析

摘要：

为确诊重庆涪陵地区一山羊养殖场发生山羊皮下脓肿的病原,采集病料分离病原、进行药敏试验.通过生化试验和16S rRNA分子方法鉴定病原菌;PCR扩增分离株的神经氨酸酶基因(neuraminidase,NA),并利用细菌神经氨酸酶的隐马尔科夫模型(Pfam编号为PF13088)搜索自建的本地蛋白质组数据库,通过MEGA7.0构建系统进化树,从而分析神经氨酸酶基因在脊椎动物、寄生虫、真菌、细菌和病毒中的遗传进化特征,并利用PredictProtein进行分离株神经氨酸酶的点突变分析.结果表明,分离株的16S rRNA基因与JQ975932.1(中国新疆)株化脓隐秘杆菌序列同源性高达99.7％,结合生化特性确诊分离株为化脓隐秘杆菌;利用模型进行检索,共检索到21 4条神经氨酸酶氨基酸序列.神经氨酸酶遗传系统进化树显示,细菌神经氨酸酶主要集中在放线菌门中,脊椎动物的神经氨酸酶主要聚集在Group Ⅰ和Group Ⅱ,寄生虫的神经氨酸酶主要集中于Group Ⅰ,真菌神经氨酸酶分布较广,存在Group Ⅰ、Group Ⅱ以及GroupⅣ中,而病毒神经氨酸酶主要分布于Group Ⅰ和Group Ⅱ.点突变分析表明,细菌神经氨酸酶不同位点的氨基酸突变对神经氨酸酶功能的影响不同.

关键词：山羊、化脓隐秘杆菌、分离鉴定、神经氨酸酶、遗传进化

所属期刊栏目：38

分类号：S852.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：“十二五”国家科技支撑计划资助项目2011BAD36B00;西南大学博士启动基金资助项目2013BSr03

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：665-670