基因重组型番鸭细小病毒FJM3的全基因组特征

摘要：

从1例未免疫雏番鸭细小病毒活疫苗与鹅细小病毒活疫苗的临床病死雏番鸭脏器中成功分离到1株番鸭细小病毒(FJM3株).为明确其基因组特征,运用PCR方法,扩增出番鸭细小病毒FJ M3株全基因组.结果表明,FJM3株基因组全长为5017 nt,其基因组结构和经典番鸭细小病毒参考毒株一致.序列比对结果袁明,FJM3株全基因组序列与GenBank中登录的经典MDPV参考株(FM株)核苷酸序列同源性为94.0％,与番鸭源GPV参考株(Y株)核苷酸序列同源性为85.6％.全基因组遗传进化分析表明,FJM3株处于MDPV遗传进化分支;VP1基因遗传分析表明,FJM3株处于经典MDPV遗传进化分支;VP3遗传进化表明,FJM3株处于GPV遗传进化分支.对FJM3株和参考株(FM株、Y株和SYG61v)进行遗传重组分析表明,该毒株于存在2处MDPV与GPV的基因重组现象.

关键词：番鸭细小病毒、基因组、重组、序列分析

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分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：现代农业产业体系建设专项基金资助项目CARS-43;公益行业农业科研专项基金资助项目201003012;福建省农业科学院“青年科技英才百人计划”项目YC2015-12;福建省自然科学基金资助项目2015J01114;新世纪“百千万人才工程”国家级人选科研补助基金资助项目NCNCMTPC-2009

在线出版日期：2017-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1836-1841