靶向大肠杆菌(E.coli)黏肽合成酶PBP1b的抗菌先导化合物的虚拟筛选

摘要：

大肠杆菌(E.coli)是一种常见的致病菌,大肠杆菌的黏肽合成酶PBPlB对于它的细胞壁合成和存活具有至关重要的作用,是β-内酰胺类抗生素的作用靶点.但是,由于抗生素滥用等原因,目前已造成了大肠杆菌时β-内酰胺类抗生素较强的耐药性.本研究针对大肠杆菌的黏肽合成酶PBP1B,通过分子对接软件IOCK6.5进行虚拟筛选,以期得到具有全新结构的高亲和力的先导化舍物,用作新型抗菌药物.我们对含104万个化合物的ZINC数据库进行了虚拟筛选,以grid score进行了第1轮打分,得到分值在—30 kcal/mol以下的化合物约6万个,从中挑选出打分高的600个化合物进入第2轮筛选,采用amber score进行第2轮打分,筛出分值在-20 kcal/mol以下的化合物约200个.对这些化合物进行分析,最终挑选2种打分高并且结构新颖的先导化合物,并进行了有机合成.采用MH肉汤稀释法检验了先导化合物的抗菌活性,发现先导化合物对常见革兰阳性菌和革兰阴性菌均有抗菌活性,并且抗菌活性比具有相似结构的磺胺嘧啶更强.因此,这2种先导化合物有望进一步开发为新型抗菌药物.

关键词：细菌耐药性、虚拟筛选、大肠杆菌、黏肽合成酶、PBP1B、DOCK6.5

所属期刊栏目：36

分类号：S852.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：浙江省自然科学基金资助项目LY12C19011;浙江工商大学大学生创新基金资助项目1110XJ1712168;食品科学与工程浙江省重中之重一级学科资助项目JYTSP20141052

在线出版日期：2016-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：469-474