猪CD74基因克隆、分子特性及其功能区结构研究

摘要：

为研究猪CD74分子特性和功能,应用RT-PCR和RACE(rapid amplification of cDNA Ends)技术从猪脾脏细胞中克隆了完整的猪CD74基因.根据已知的部分CD74基因保守区序列.自行设计1对简并引物,扩增CD74较为保守的部分基因片段,根据测序结果设计系列引物扩增CD74基因,最后根据全基因测序结果设计1对特异性引物扩增猪CD74全长基因.分析和比对测序结果显示,完整的猪CD74基因全长存在1 145、1 337 nt 2种类型,对应编码阅读框为651、843 nt,分别编码217和281个氨基酸,提示猪CD74存在2种异构体结构.氨基酸序列研究表明,猪CD74与其他物种的CD74分子存在类似的胞浆区、跨膜区、内质网区和甲状腺区等功能区,存在L7I8和P15M16 L17两个内体定位基元,内质网区包含CLIP区和三聚体区等结构域,异构体1 337 nt较1 145 nt多了编码64个氨基酸的Tg区.遗传进化分析显示,猪CD74与哺乳类物种间存在较高同源性,可达57％～82％,与禽类的CD74同源性为45％～51％,与鱼类、爬行类物种同源性最低仅为25％～34％o.3D模拟结构显示,猪CD74与小鼠、人及禽类CD74存在类似的结构域,其中在一些关键部位氨基酸基本相同.

关键词：CD74、基因克隆、RACE、分子特性

所属期刊栏目：36

分类号：S852.23(动物医学（兽医学）)

资助基金：山东省自然科学基金资助项目ZR2013CQ006

在线出版日期：2016-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：395-400