毛皮动物肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛A基因克隆测序与生物信息分析
根据GenBank中肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛结构基因A(MrkA)JF759921的序列设计1对引物,对8株毛皮动物肺炎克雷伯菌进行克隆测序,并应用生物信息学相关软件和方法,预测MrkA蛋白二级结构和B细胞抗原表位.PCR扩增出了609 bp的目的基因片段,生物信息分析结果显示其开放阅读框架为609 bp,编码202个氨基酸;二级结构以无规卷曲为主,有少量的a-螺旋和β-片层,少见β-转角,推测MrkA蛋白有8个B细胞优势抗原表位区域.结果表明,MrkA基因较稳定,其在进化过程中并未发生明显变异,为进一步分析肺炎克雷伯菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础.
肺炎克雷伯菌、MrkA基因、二级结构、B细胞抗原表位预测
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S852.61(动物医学(兽医学))
国家自然科学基金资助项目30972183,31272595
2015-02-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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