猪IGF-1R基因启动子区单核苷酸多态性检测分析

摘要：

本试验对猪混合基因池中胰岛素样生长因子-1受体基因(IGF-1R)启动子区进行克隆并测序,筛查不同猪种间的突变位点并对其转录因子结合位点进行预测.采用AS-PCR方法,对巴马香猪、西藏小型猪、军牧1号白猪、东北野猪和大白猪5个品种猪的IGF-1R启动子区进行了单核苷酸多态性分析.结果表明该基因启动子区上存在2个SNPs位点(G-1 440C,C-1 165T),但均未引起转录因子结合位点的变化.在G-1 440C位点,5个猪种出现3种基因型,分别为GG,GC,CC,其中巴马香猪的等位基因频率G％=C％,其余4个猪种优势等位基因为G;在C-1 165T处,存在CC,CT,TT 3种基因型,西藏小型猪的优势等位基因为T,其余4个猪种优势等位基因为C.2个突变位点的基因型分布差异极显著(P＜0.01).

关键词：猪、IGF-1R基因、AS-PCR (allele-specific PCR)、SNP

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分类号：S828;Q786(家畜)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31101781,31072102;高等学校博士学科点专项科研基金资助项目20110061110081

在线出版日期：2014-12-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1689-1692,1698