广东省鸡传染性贫血病毒编码区基因的克隆与分子进化分析

摘要：

为了解鸡传染性贫血病毒(chicken anemia virus,CAV)广东分离株变异情况,通过PCR方法克隆了于2012年分离到的10株CAV的编码区序列,并对其进行了测序及分子进化分析.结果显示,广东CAV分离株编码区全长1 823 bp,含有3个互相重叠的开放阅读框(ORF).序列分析表明,广东省CAV分离株与GenBank上已发表的其他36株CAV比较,VP1核苷酸的同源性在94.1％～99.2％之间,推导出的氨基酸的同源性在95.3％～99.3％之间;VP2的核苷酸同源性在98.2％～100％之间,推导出的氨基酸的同源性在95.9％～99.5％之间;VP3的核苷酸同源性在97.8％～100％之间,推导出的氨基酸的同源性在95.1％～99.2％之间;VP1蛋白共有17个位点发生了变异,VP2蛋白共有11个位点发生了变异,VP3蛋白共有6个位点发生了变异.分子进化分析显示,10株CAV广东分离株主要位于两个分支,其中9株CAV分离株与GenBank上已发表的35株CAV处于一个大分支,而GD-N-12与分离株KC414026处于另外一个小分支,由此得出其中9株广东CAV分离株是目前主要的流行毒株.

关键词：CAV、编码区、分子进化分析

所属期刊栏目：34

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：广东省重大科技基金资助项目2009B020201008

在线出版日期：2014-04-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：402-405,410