副猪嗜血杆菌寡肽结合蛋白（OPPA）的序列分析及分子结构模拟

摘要：

通过研究副猪嗜血杆菌（Haemophiius parasuis，Hps）寡肽结合蛋白（Oligopeptide Binding Protein A，OppA）的生物学特性，为副猪嗜血杆菌亚单位疫苗的研制奠定基础。本试验设计了1对特异性引物，应用PCR方法来扩增副猪嗜血杆菌肽聚糖相关脂蛋白的全基因序列，并进行克隆和测序。并且采用生物信息学方法，对Hps的oppA基因核苷酸及其对应氨基酸序列进行比对，选取其中的血清学5型分离株，对其OppA蛋白的分子结构、理化性质及结构功能域、蛋白质二级结构等重要参数进行了预测和分析，并对0ppA蛋白的三级结构进行了同源建模。PCR扩增出1638bp的目的片段；测序结果显示出不同血清型Hps之间oppA基因核苷酸序列相似性有一定的差异，而所对应的氨基酸序列却差异更小；OPPA蛋白的理论等电点为6．45，偏弱酸性；OppA蛋白的二级结构以α螺旋、不规则卷曲和8片层为主要构件；Hps的0ppA蛋白的氨基酸序列与鼠疫耶尔森氏菌2223蛋白的同源性为57．20％，以2223蛋白结构为模板成功构建了Hps的OppA蛋白三维结构分子模型，该OppA蛋白三维结构中与2223蛋白相似，也有3个结构域，在疏水口袋中有1条5肽结构。Hps的OppA蛋白的成功模建为OppA蛋白功能的深入研究提供了参考依据。

关键词：副猪嗜血杆菌、寡肽结合蛋白、序列分析、分子结构模拟

所属期刊栏目：32

分类号：S852.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：福建省公益类科研专项基金资助项目2010R1025-2;国家公益性行业农业科研专项基金资助项目NYHYZX07-034

在线出版日期：2012-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：839-843,861