猪戊型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法的建立及其分子流行病学
对已发表的戊型肝炎病毒(HEV)不同基因型毒株全序列进行分析,针对ORF3的保守区设计引物和探针优化建立了HEV荧光RT-PCR检测体系.分析表明该反应体系具有良好的扩增效率、特异性和稳定性,且检测灵敏度比普通RT-PCR方法高10～100倍.利用所建立的荧光定量PCR方法对采集自浙江及其周边上海、江苏等地区规模化猪场的样品以及HEV抗体阳性人血清样品进行了HEV核酸检测.其中,77份人血清样本仅有2份为HEV核酸阳性(2.6%).而猪粪便样品阳性率则高达20.5%(56/273),且所调查的猪场均存在HEV感染.进一步的分子流行特征分析表明,浙江及周边地区的猪HEV毒株多为基因Ⅳ型,与其他地区的Ⅳ型HEV毒株同源性较高(83.4%～89.5%),但它们之间也存在较多的变异位点.猪源HEV毒株PJ-1则与多数Ⅲ型HEV毒株同源性较高(88%),进化分析也表明其为基因Ⅲ型.人血清样品中检测到的2份HEV毒株Human-1与Human-2与本地区Ⅳ型猪源毒株在分子进化关系上具有很高的亲源性,它们分布于同一分支内,而不构成独立分支.以上分析结果表明浙江及其周边地区猪HEV感染较为广泛,且以基因Ⅳ型毒株为主,但也存在基因Ⅲ型毒株的流行.
戊型肝炎病毒、荧光定量PCR、基因型、分子进化
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S852.651(动物医学（兽医学）)
浙江省国境安全检验检疫科技创新服务平台资助项目2006C17014;浙江出入境检验检疫局科技基金资助项目ZK200611
2011-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
822-827
