牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析
研究牛乳蛋白不同氨基酸的密码子使用频率对利用乳腺生物反应器表达目标蛋白过程中密码子的优化具有重要意义.本试验运用ENBOSS的CHIPS和SMS中的密码子使用工具对7种牛乳蛋白编码的基因进行了分析,并将这7个编码序列拼接在一起进行了乳蛋白全基因组的密码子偏爱性研究,同时与绵羊、猪及小鼠的乳蛋白密码子偏爱性进行了比较.结果表明:牛乳蛋白的CHIPS分析Nc值为51.867,αs1-CN、αs2-2-CN、β-CN、κ-CN、α-LB、β-IG、LTF的Nc值分别为52.005、49.967、48.746、58.113、55.514、36.274、47.646,编码牛乳蛋白氨基酸的密码子出现频率较均一;牛乳蛋白V、A、R、I、T、L、Q、P等氨基酸的密码子使用频率与其他物种有较大差异.牛乳蛋白的密码予偏爱性与绵羊最为接近.
牛乳蛋白、密码子使用频率、蛋白编码序列的密码子异质性、密码子偏爱性
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S823.2(家畜)
转基因生物新品种培育重大专项资助2008ZX08007-001;2009ZX08009-156B;2009ZX08007005B
2011-07-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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