猪伪狂犬病病毒蛋白激酶基因的克隆及其部分生物信息学分析

摘要：

采用PCR方法扩增出12株伪狂犬病病毒(PRV)的蛋白激酶(Protein Kinase,PK)基因全序列,并测序,使用生物信息学软件对这12株PRV的PK基因序列以及GenBank登录的6条PK基因序列进行了生物信息学分析和预测.结果显示,PRV PK基因开放阅读框的核苷酸长度为1107～1170 bp,氨基酸长度为368～389个;核酸和氨基酸的同源性分别为96.7%～100%和73.9%～100%;在PK基因核酸序列1079～1099 bp和240～250 bp处有2个高变重复区;蛋白质疏水性、抗原表位的分析结果十分相似,而且PK基因编码的蛋白质均具有真核细胞丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化结构域的保守氨基酸共有序列和亚结构域特征序列.结果表明,PRV PK基因在大部分毒株具有较高的保守性.

关键词：伪狂犬病病毒、蛋白激酶基因、序列分析、生物信息学

所属期刊栏目：30

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：教育部长江学者和创新团队发展计划项目IRTO555;国家"十一五"科技支撑计划项目2006BAD06A18-3

在线出版日期：2010-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1032-1037,1048