猪流感病毒H9N2亚型济南株HA、NA基因的克隆与序列分析
根据GenBank中流感病毒H9N2亚型HA基因与NA基因序列,分别设计扩增HA基因与NA基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒H9N2济南株(SW/SD/JT/07)HA基因和NA基因,分别将RT-PCR扩增产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析.结果表明,SW/SD/JT/07 HA基因长度为1 701 bp,编码566个氨基酸,HA0切割位点序列为R-S-SR-G,属非高致病性毒株;HA蛋白有8个糖基化位点,与参考毒株糖基化位点数一致;HA蛋白有5个受体结合位点,其中在190位氨基酸与其余参考毒株存在差异.SW/SD/JT/07 NA基因长度为1 413 bp,编码470个氨基酸,NA蛋白基质结合部与参考毒株一致,高度保守;NA蛋白有5个抗原位点,在325位为D其余参考毒株均为N,SW/SD/JT/07与DC/HB/W1/04,CK/GS/2/99在398位为E,其余参考毒株为D或N;SW/SD/JT/07 NA蛋白与CK/SH/F/98,DC/HB/W1/04,CK/GS/2/99,SW/GD/WXL/04,SW/SD/W4/03,SW/YN/Sima02/07一样在茎区63,64,65位发生氨基酸缺失.SW/SD/JT/07 HA基因与参考毒株的同源性82.5%～98.6%,NA基因与参考毒株的同源性82.2%～99.1%.SW/SD/JT/07 HA基因与NA基因系统发生树分析表明,SW/SD/JT/07与AIV H9N2亚型亲缘关系密切.
猪流感病毒、H9N2亚型、HA基因、NA基因、克隆、序列分析
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S852.65;R535(动物医学（兽医学）)
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金2008BS07017;山东出入境检验检疫局科研基金SK03-2004
2010-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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