新城疫病毒F48E9株及东北地区流行株F基因遗传变异分析

摘要：

采用异硫氰酸胍/酚/氯仿抽提一步法,提取新城疫病毒(NDV)F48E9株及2个东北地区分离株DB3、DB5基因组RNA,并以其为模板经反转录合成 F基因cDNA第1链,再利用PCR技术分段扩增出F基因的cDNA.F48E9、DB3和DB5株F基因的cDNA 经酶切修饰后,插入pUC19的多克隆位点中,转化感受态E.coli DH5α.经相对分子质量比较、酶切分析及PCR等鉴定方法筛选出F48E9、DB3和DB5株F基因的阳性克隆.然后采用S an ger′s双脱氧末端终止法对阳性重组子进行核苷酸序列测定,证实分别获得了F48E9、D B3和DB5株F基因的全长cDNA.利用DNASIS及MEGA分析软件,将上述3个毒株的F基因序列与基他11株有代表性的NDV的相应序列进行比较分析,并绘制了14株NDV F基因的系统发育进化树.结果表明,F48E9和DB3株在核苷酸序列上相对独立于Toyoda等所分的A、B、C组,单独成为一组;DB5株与B1 Hitchner株同属B组,说明它们具有较高的同源性.同时也证明我国有不同基因型的毒株在流行.从进化的角度来看,NDV各毒株间确实存在遗传变异,但F蛋白主要功能区遗传相对稳定.

关键词：NDV、F基因、克隆、序列分析、系统发育进化树

所属期刊栏目：20

分类号：S852.65;Q78(动物医学（兽医学）)

资助基金：科技部攀登计划85-44-01-44;中国科学院资助项目39893290-4

在线出版日期：2004-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：117-120