应用多联PCR对引发猪繁殖障碍有关病毒的检测Ⅰ.JEV、PPV、PRRSV、PRV多联PCR引物设计

摘要：

首先在GenBank查出日本乙型脑炎病毒(JEV)、伪狂犬病病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸系统综合征病毒(PRRSV)和猪细小病毒(PPV)基因组的所有已知序列,对各病毒基因区域进行同源性分析,结合各病毒基因组的结构特点,发现并确定了PRV的gH基因区、JEV的多聚蛋白基因区、PRRSV的结构蛋白区和PPV的VP2基因区为各自病毒保守序列.利用Goldkey软件对上述保守的特殊序列进行引物设计,要求G+C含量47%～60% ,长度18～25 bp,Tm值72～85之间.对设计出的4种病毒引物再用VNTI30软件进行引物之间二级结构分析,以避免引物之间形成稳定的结构二聚体.选出扩增片段分别为PRV 125 bp、 PRRSV 263 bp、PPV 313 bp、JEV 375 bp的4对引物,并进行了每对引物扩增片段序列的同源性分析或互补性分析,以避免它们之间具有过高的同源性.最终确定了这4种病毒的多联PCR 引物,从而为建立这4种病毒的多联PCR方法奠定了基础.

关键词：JEV、PPV、PRRSV、PRV、多联PCR、引物设计

所属期刊栏目：20

分类号：S854.4;Q78(动物医学（兽医学）)

在线出版日期：2004-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：10-14