猪流行性腹泻病毒YZ2016全基因组测序与稳定性分析

摘要：

2016年我国江苏扬州某规模化养猪场暴发严重腹泻,本实验室通过RT-PCR确定其病原为猪流行性腹泻病毒(PEDV).将阳性样品接种Vero细胞,盲传5代后出现典型病变,并通过RT-PCR及间接免疫荧光试验确定成功分离到PEDV毒株,命名为PEDV YZ2016.采用分段重叠法对分离株基因组扩增测序,获得其全长序列.遗传进化分析显示PEDV YZ2016与近年流行毒株亲缘关系较近,与经典毒株亲缘关系较远.PEDV YZ2016与BJ-2011-1、LZW全基因组核苷酸序列一致性可达99.2％,与BJ-2011-1、OKN-1/JPN/2013 S基因推导氨基酸序列一致性可达98.5％.此外,分离株S基因发生多处点突变,导致其抗原表位及糖基化位点均发生部分改变.同时,序列比对分析显示不同代次的S、ORF3、N基因核苷酸突变率均极低.结果 表明,本研究分离的PEDV YZ2016株属流行变异毒株,且在传代过程中遗传稳定性良好.

关键词：猪流行性腹泻病毒、分离鉴定、全基因组测序、序列分析

所属期刊栏目：49

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划

在线出版日期：2019-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：895-903