2006-2016年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株四个基因的进化动态分析

摘要：

为研究广西猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传进化情况,对2006-2016年间,来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行了病毒Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因的扩增、测序及进化分析.结果,获得的Nsp2-l、Nsp2-2、ORF5、ORF6、ORF7基因的片段长度分别是1667、1649、603、525、172 bp,均为美洲型毒株;Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因核苷酸及其推导的氨基酸序列的同源性分别为86.8％～ 100％和61.7％～100％、80.8％～100％和80.5％～100％、90.6％～100％和89.9％～100％、85.6％～100％和87.1％～100％;基于Nsp2、ORF5、ORF6及ORF7基因核苷酸序列分别绘制的进化树可将所有毒株分为6个亚群,而广西流行的PRRSV毒株主要分布在以JXA1株为代表的亚群6.Nsp2、ORF5、ORF6和ORF7的平均进化速率分别为1.69×10-1、58×10-2、971×10-4、1.86×10-3 substitutions/site/year.Nsp2基因是最容易发生变异的,其次是ORF5基因与ORF7基因,而ORF6基因最稳定.本研究为掌握PRRSV的分子流行病学及遗传进化规律提供了相关的基础数据.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、基因、遗传变异、进化动态

所属期刊栏目：48

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西科学研究与技术开发计划项目桂科转14125004-22;广西科技重大专项桂科AA17204057

在线出版日期：2018-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：616-624