2014-2015年我国华东部分地区猪流行性腹泻病毒的检测及S基因的序列分析

摘要：

采用RT-PCR方法对2014年至2015年送至实验室的104份腹泻仔猪小肠组织病料进行检测,结果显示42份为猪流行性腹泻病毒(PEDV)阳性,选择不同地区的7份阳性病料进行S基因克隆和测序,并与GenBank中已发布的PEDV S基因比对分析.核苷酸和氨基酸比对结果显示,7株流行毒株S基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别是98.1％～99.2％和97.6％～99.1％.该7株流行毒株与经典毒株CV777和DR13核苷酸序列的同源性分别为94.0％～94.2％和93.9％～94.1％,氨基酸序列的同源性分别为93.1％～93.6％和92.5％～93.1％.S基因进化树分析结果表明,根据S基因的变异情况PEDV可以分为3个型,本试验分析的7株PEDV流行毒株均属于Ⅲ型,与2012年以来中国流行毒株的亲缘关系较近,与国外传统毒株和中国较早分离到的毒株的亲缘关系较远.

关键词：猪流行性腹泻病毒、S基因、遗传变异分析

所属期刊栏目：46

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：南京农业大学校内项目KJQN201619

在线出版日期：2016-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：702-709