锦鲤疱疹病毒CJ株ORF83基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株（KHV-CJ）ORF83蛋白的结构特征和进化关系,用框镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF83基因,将其克隆到pMD18-T载体中,构建重组质粒。应用生物信息学方法初步分析KHV-CJ ORF83基因的结构和功能,并与GenBank上已公布的3株KHV构建系统进化树。结果显示,获得了长687 bp的ORF83基因,编码229个氨基酸;编码蛋白的理论分子质量为25 822.18 u,等电点为8.600;疏水性为-2.733～3.100;信号肽切割部位最可能位于第22位的G（甘氨酸）和第23位的V（缬氨酸）之间;跨膜结构分析表明,ORF83有4个跨膜区;抗原表位预测显示,编码蛋白的抗原性良好;结构预测显示,ORF83可能存在1个N-糖基化位点、11个O-糖基化位点和13个磷酸化位点;系统进化树分析显示,KHV-CJ株与锦鲤疱疹病毒美国株和以色列株属同一分支。结果表明,ORF83基因编码的蛋白可能具有较好的免疫原性,能够诱导产生中和抗体。

关键词：锦鲤疱疹病毒、ORF83基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：41

分类号：S852.659.1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金30671621

在线出版日期：2012-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1016-1020