贵州省猪戊型肝炎的分子流行病学调查

摘要：

采集贵州省戊型肝炎病毒（hepatitis E virus,HEV）抗体阳性的6个猪场新鲜猪粪便样品216份,提取RNA,通过RT-nPCR扩增HEV ORF2基因,对阳性PCR产物进行克隆和测序,采用MEGA5.05软件进行序列比对,构建系统发生树,并经流行病学分析,调查了贵州省猪群的HEV感染情况及基因型。结果显示,HEV主要感染1月龄以上的未成年猪群;粪样采集的6个猪场均不同程度（5.88%～56.52%）地检出HEV RNA阳性,总体阳性率为22.69%（49/216）,场群阳性率为100%（6/6）;不同类型猪场（养殖户型和养殖场型）HEV RNA阳性率（分别为41.10%和13.29%）差异具有统计学意义（P〈0.01）,养殖户之间及养殖场之间的阳性率差异无统计学意义（P〉0.05）,但随着饲养时间的延长,这2种类型猪场的粪便HEV RNA检出率呈上升趋势;测序36个PCR阳性分离株（占73.5%）,序列一致性为91.1%～100%,与HEV禽型及Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型的一致性分别为52.4%～55.4%、75.2%～77.9%、73.6%～75.9%、72.7%～79.1%、83.2%～95.6%,系统发生分析显示与Ⅳ型在同一分支上,属于基因Ⅳ型。结果表明,贵州省猪群普遍存在HEVⅣ型感染。

关键词：猪、戊型肝炎病毒、基因型、反转录巢式聚合酶链反应、流行病学调查

所属期刊栏目：41

分类号：S855.3;R183.4(动物医学（兽医学）)

资助基金：黔科合院所创能项目2008]2137;2010]4004

在线出版日期：2012-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：960-967